Земля. Лю Кан только что вернулся с турнира "Смертельный поединок" одержав победу над тёмным магом Шан Тсунгом, обеспечив ещё одному земному поколению мирную жизнь. Но вдруг на землю находят чёрные тучи и открывается портал, из которого выходит Шао Кан и воины Антимира. Лю Кан, Рейден, Соня, Китана, Ночной Волк, Смоук (недавно перешедший на сторону добра), Нуб Сайбот и Кенши смогли отбить эту попытку завоевать землю и Шао Кан отправился в свою резеденцию, но там теёмный маг Куан Чи воскресил своего друга Шан Тсунга. После этого началась новая война между Землёй и Антимиром.